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大规模、数据驱动的生物医学研究需要在研究计算方面的协调投资,因此,2009年创建了研究计算核心来开发此类设施。2017年,Core与新成立的大数据研究所(BDI)建立了合作关系,其愿景是提供一个跨两个院系的统一生物医学研究计算(BMRC)平台,以及来自牛津大学周围的合作者。BMRC现在是大学里数据驱动、高内存、高性能计算的杰出设备。随着大学在提供研究计算方面采用越来越多的联合方法,BMRC设施已经支持了来自十多个院系的研究人员,他们都为该设施的持续增长做出了贡献。

生物医学研究计算标志WHG GPFS文件系统BDI主要设备室

随着BMRC活动范围的扩大,关于我们做什么、如何做以及如何收费的描述正集中于BMRC节医学科学部的网站(目前要求的牛津SSO)。

要联系迈博国际app安卓下载BMRC团队对所有支持,咨询和信息给我们发电子邮件bmrc-help@medsci.ox.ac.uk

主要设施的概述

目前,在WHG和BDI的服务器机房中,BMRC提供近7000个集群计算核心、60个集群GPU卡、10PB原始高性能(频谱规模)存储和8PB原始低级存储,用于数据采集和存档。我们鼓励所有WHG研究人员使用我们的平台,并提供培训和研讨会,以帮助人们开始。BMRC维护了一组广泛的>300应用程序,研究人员可以使用它们,并确信它们已被正确编译和安装。

此外,我们运行的OpenStack云与1200个内核和40分的GPU由300TB极致性能NVMe Ceph的支持和我们开始鼓励研究团体迁移到这个平台上。

BMRC还运行一个较小的高遵从性安全VDI/云平台、一个测试和开发OpenStack云以及一个小型oVirt VM平台。我们也在探索新的存储平台,从超高速的NVMe-over-fabric到批量的s3兼容对象存储。所有这些平台都连接在我们的100g以太网和EDR无限带宽网络上。