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除了自己的研究计划,我们的一些核心群体提供一系列的科学服务研究中心本身群体,在牛津部门的其他大学和其他机构。此外,该中心还提供了许多的数据库和应用软件可以免费使用。

有关特定核心组的更多信息,请参见旁边或下面的链接。

高通量基因组学

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牛津基因组中心提供:

利用许多最新的商业技术平台提供全面的基因组学应用程序。

  • 高通量测序(Illumina公司NovaSeq,HiSeq4000,HiSeq2500,NextSeq和MiSeq,ONT奴才,PromethION)
  • 基因分型和甲基化研究(Illumina公司,Affymetrix公司)
  • 表达谱(Illumina公司,Affymetrix公司)
  • 单细胞分离和分析(10X基因组学,索尼FACS)
  • 高度自动化的过程(Labcyte, Wafergen和Beckman)
  • LIMS样品追踪

生物信息学和统计遗传学

BSG提供了以下几个方面的建议和支持:

  • 实验设计建议
  • NGS数据(Illumina和ONT)和微阵列的处理和分析管道
  • 确保高质量的数据,并提供QC报告
  • 广泛的信息学支持跟踪,处理和管理大量的原始序列数据
  • 对使用各种生物信息学工具和分析的培训和咨询
  • 与研究小组合作进行下游分析
  • 开发软件工具,以帮助科学家组学数据集的分析
  • 从尖端的技术和方法(例如单细胞)的试验评价数据
  • 与稿件准备和提交数据到公共仓库援助

染色体动力学

染色体动力学提供:

  • 多种不同的荧光原位杂交(FISH)应用
  • 相关组织培养技术
  • 探针制备
  • 支持细胞学技术,包括免疫荧光和显色RNA原位杂交(ISH)

细胞成像

细胞成像提供:

  • 先进的荧光显微镜和光谱学实验室,在数字成像和定量显微镜应用于活细胞的技术援助。
  • 该细胞成像核心进行研究和前沿荧光显微镜技术的发展。寿命成像,荧光相关光谱和超分辨率显微镜方法可用。
  • 该细胞成像的核心也传播的荧光光谱应用知识,科学界。

转基因

转基因提供:

  • 转基因小鼠模型的生成
  • 在胚胎干细胞基因打靶
  • 敲除和基因敲除在结构设计
  • 代Rosa26敲入小鼠
  • 株胚胎移植导入到FGF
  • 冷冻保存的菌株
  • 辅助生殖

生物医学研究计算

生物医学研究计算提供:

  • 用于跨WHG和BDI的高性能计算的本地设施
  • 高性能批次(集群)计算:Univa公司的网格引擎拥有近7000个CPU核心和GPU 60卡
  • 正确编译和安装科学应用程序的广泛套件>300的共享使用
  • 大型、快速存储系统:10PB的频谱规模(GPFS),最高可达50GB/s
  • 牛津大学的只有内部部署云平台:OpenStack的平台,1200个CPU核心和GPU 40卡支持通过300TB NVMe头孢高达80GB / s的
  • 存储的廉价层用于保存旧数据:每6个月目前(2019年1月)£10.60每TB
  • 先进的网络,包括使用积云的100Gbit/s开放以太网,EDR (100Gbit/s) InfiniBand和WHG与BDI之间的私人400Gbit/s链接
  • 牛津大学的只有高遵守安全VDI /云平台
  • 用于OpenStack、oVirt和S3对象存储的测试和开发平台
  • 使用这些设施的培训和研讨会

它。

它。提供:

  • 网络基础设施和服务器托管
  • 电子邮件服务
  • 网络打印
  • 共享网络存储、数据存档、备份和文件恢复
  • 安全的虚拟主机
  • 远程访问设施(拨号、ISDN、VPN和Windows应用服务器)
  • 网络、服务器和工作站安全
  • 最终用户支持