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从WCHG三GMS学生们最近参加了惠康,桑格研究所的首届生物数据的编程马拉松(#BioDataHack),并在其类别捧回了最高奖。

HRIS Eijsbouts(2017年),克里斯·科尔(2017年),和Jonas Bovijn博士(2016)是一个团队的五个一种新颖的方法处理为确定药物靶标为阿斯利康挑战的一部分的一部分。他们将继续开发自己的解决方案,“拓扑知情药物发现”,或TINDR,与导师的在公司的帮助。

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该生物数据的黑客马拉松由惠康基因组校区辛克斯顿主办,剑桥附近七月第2-3,并从遗传学和医疗信息的各个领域几乎汇聚了150的黑客。团队由来自临床医学统计,计算生物学和业务的不同技能的人。五个组织发起的挑战,选手们自由设计创新的解决方案对他们的各种专门知识。阿斯利康公司,跨国公司PHARMACeutical补偿任何其总部设在剑桥,扔下战书与广大的挑战,“使用机器学习和/或AI地图药物与疾病的关系”。该团队,其中也包括剑桥博士研究生蒂莫西·詹金斯,以及伦敦大学国王学院博士后研究员海伦娜加斯帕博士,试图预测潜在的药物靶点基于从蛋白质 - 蛋白质相互作用网络信息的特定疾病。选择并送入卷积神经网络(CNN),了解药物靶点如何趋向于被“连接”到其它蛋白质的网络的相关部分。这些信息被用来确定新的蛋白质具有连接功能相似到E配合建立的药物靶点。

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目前该团队与阿斯利康会谈继续他们的工作。在此期间,他们创造的R包,它仍处于开发阶段。